MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 6643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	AGA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009926	GAA	2	6	46	51	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009926	TGC	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009926	CTG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009926	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009926	ATC	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009926	TCA	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339654
8	NC_009926	AGA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339654
9	NC_009926	TGC	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339654
10	NC_009926	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339654
11	NC_009926	AGG	2	6	392	397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339655
12	NC_009926	TGC	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339655
13	NC_009926	CAG	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339655
14	NC_009926	AAT	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339655
15	NC_009926	CTT	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339656
16	NC_009926	GCA	2	6	576	581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339656
17	NC_009926	CT	3	6	720	725	0 %	50 %	0 %	50 %	158339656
18	NC_009926	TTCCG	2	10	796	805	0 %	40 %	20 %	40 %	158339656
19	NC_009926	AGCT	2	8	854	861	25 %	25 %	25 %	25 %	158339656
20	NC_009926	TGA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339656
21	NC_009926	A	6	6	1038	1043	100 %	0 %	0 %	0 %	158339656
22	NC_009926	AAT	2	6	1084	1089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158339656
23	NC_009926	GTG	2	6	1111	1116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339656
24	NC_009926	CAATC	2	10	1162	1171	40 %	20 %	0 %	40 %	158339656
25	NC_009926	CGAT	2	8	1209	1216	25 %	25 %	25 %	25 %	158339656
26	NC_009926	TGT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339656
27	NC_009926	CAGC	2	8	1298	1305	25 %	0 %	25 %	50 %	158339656
28	NC_009926	ATC	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009926	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009926	AG	3	6	1449	1454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009926	TGCG	2	8	1503	1510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009926	CT	3	6	1596	1601	0 %	50 %	0 %	50 %	158339657
33	NC_009926	CT	3	6	1623	1628	0 %	50 %	0 %	50 %	158339657
34	NC_009926	CT	3	6	1634	1639	0 %	50 %	0 %	50 %	158339657
35	NC_009926	TTC	2	6	1666	1671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339657
36	NC_009926	TGA	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339657
37	NC_009926	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158339657
38	NC_009926	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	158339657
39	NC_009926	CGA	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339657
40	NC_009926	ATTT	2	8	1865	1872	25 %	75 %	0 %	0 %	158339657
41	NC_009926	T	7	7	1870	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	158339657
42	NC_009926	GAG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339657
43	NC_009926	TCT	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339657
44	NC_009926	A	6	6	1979	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	158339657
45	NC_009926	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009926	ACA	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009926	CAG	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009926	CTT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009926	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009926	CAG	2	6	2596	2601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009926	ATT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009926	TCGTGG	2	12	2633	2644	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009926	GGC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009926	ACACT	2	10	2689	2698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009926	TCCCCA	2	12	2712	2723	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009926	TCAT	2	8	2736	2743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009926	CTT	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339658
58	NC_009926	AGC	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339658
59	NC_009926	GCA	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339658
60	NC_009926	TAGC	2	8	2887	2894	25 %	25 %	25 %	25 %	158339658
61	NC_009926	CAT	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339658
62	NC_009926	GAGC	2	8	3044	3051	25 %	0 %	50 %	25 %	158339658
63	NC_009926	GGT	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339658
64	NC_009926	GA	3	6	3323	3328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009926	ATCA	2	8	3339	3346	50 %	25 %	0 %	25 %	158339659
66	NC_009926	TTC	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339659
67	NC_009926	CAA	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339659
68	NC_009926	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	158339659
69	NC_009926	GAA	3	9	3531	3539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339659
70	NC_009926	GCAA	2	8	3562	3569	50 %	0 %	25 %	25 %	158339659
71	NC_009926	TCA	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339659
72	NC_009926	AGTT	2	8	3616	3623	25 %	50 %	25 %	0 %	158339659
73	NC_009926	TGGA	2	8	3647	3654	25 %	25 %	50 %	0 %	158339659
74	NC_009926	AGC	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339660
75	NC_009926	CT	3	6	3772	3777	0 %	50 %	0 %	50 %	158339660
76	NC_009926	ATCA	2	8	3820	3827	50 %	25 %	0 %	25 %	158339660
77	NC_009926	GAA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009926	TGG	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009926	GAG	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009926	GAA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009926	TGG	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009926	ACA	2	6	4042	4047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009926	TGG	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339661
84	NC_009926	ACT	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339661
85	NC_009926	GAATA	2	10	4146	4155	60 %	20 %	20 %	0 %	158339661
86	NC_009926	AGT	2	6	4174	4179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339661
87	NC_009926	TTC	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339661
88	NC_009926	GAG	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339661
89	NC_009926	ACA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339661
90	NC_009926	ATC	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339661
91	NC_009926	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339661
92	NC_009926	ACC	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009926	GCA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009926	TCC	2	6	4852	4857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009926	TTGA	2	8	4868	4875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009926	T	6	6	4884	4889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009926	GA	3	6	4890	4895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009926	A	6	6	5018	5023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009926	ATC	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339662
100	NC_009926	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339662
101	NC_009926	GGA	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158339662
102	NC_009926	TCA	2	6	5366	5371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339662
103	NC_009926	ATG	2	6	5417	5422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339662
104	NC_009926	GAAAC	2	10	5444	5453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009926	TGG	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009926	TGA	3	9	5626	5634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339663
107	NC_009926	TCGT	2	8	5732	5739	0 %	50 %	25 %	25 %	158339663
108	NC_009926	AGT	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339663
109	NC_009926	AGC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009926	CAG	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009926	TTAG	2	8	5960	5967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009926	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009926	TGT	2	6	6064	6069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009926	CTA	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339664
115	NC_009926	TGC	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339664
116	NC_009926	AGT	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339664
117	NC_009926	A	6	6	6410	6415	100 %	0 %	0 %	0 %	158339664
118	NC_009926	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009926	GAA	2	6	6670	6675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009926	A	6	6	6694	6699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009926	T	6	6	6863	6868	0 %	100 %	0 %	0 %	158339665
122	NC_009926	GAA	2	6	7118	7123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158339665
123	NC_009926	AGC	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339665
124	NC_009926	TTC	2	6	7152	7157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339665
125	NC_009926	AAC	2	6	7161	7166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158339665
126	NC_009926	TCCC	2	8	7199	7206	0 %	25 %	0 %	75 %	158339665
127	NC_009926	CTT	2	6	7238	7243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158339665
128	NC_009926	TCG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339665
129	NC_009926	G	6	6	7320	7325	0 %	0 %	100 %	0 %	158339665
130	NC_009926	CT	3	6	7352	7357	0 %	50 %	0 %	50 %	158339665
131	NC_009926	TTG	2	6	7440	7445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158339665
132	NC_009926	TCG	2	6	7461	7466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158339665
133	NC_009926	ACCC	2	8	7546	7553	25 %	0 %	0 %	75 %	158339665
134	NC_009926	GA	3	6	7609	7614	50 %	0 %	50 %	0 %	158339665
135	NC_009926	CCT	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158339665
136	NC_009926	TGG	2	6	7871	7876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158339665
137	NC_009926	TGA	2	6	7909	7914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339665
138	NC_009926	CAATG	2	10	7976	7985	40 %	20 %	20 %	20 %	158339665
139	NC_009926	CAG	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158339665
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257	NC_009926	TAA	3	9	14638	14646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_009926	ATG	2	6	15232	15237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158339670
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